Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLN3Q13286 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLN3Q13286 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLN3Q13286 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLN3Q13286 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLN3Q13286 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLN3Q13286 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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