Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms