Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms