Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms