Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 589.4 ms