Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 WFDC5-201ENST00000307971 1034 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC087762.1-201ENST00000559755 643 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL513327.1-204ENST00000630229 870 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms