Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms