Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC6Q03468 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms