Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

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Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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PKD1P98161 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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PKD1P98161 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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