Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms