Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB28P51157 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms