Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF6P49848 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF6P49848 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms