Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms