Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms