Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFC1P35251 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFC1P35251 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFC1P35251 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms