Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
OTX2P32243 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
OTX2P32243 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OTX2P32243 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
OTX2P32243 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OTX2P32243 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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OTX2P32243 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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OTX2P32243 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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OTX2P32243 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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OTX2P32243 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OTX2P32243 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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OTX2P32243 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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OTX2P32243 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
OTX2P32243 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OTX2P32243 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OTX2P32243 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OTX2P32243 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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OTX2P32243 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OTX2P32243 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OTX2P32243 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OTX2P32243 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OTX2P32243 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OTX2P32243 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OTX2P32243 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
OTX2P32243 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OTX2P32243 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OTX2P32243 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OTX2P32243 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OTX2P32243 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OTX2P32243 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OTX2P32243 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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