Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms