Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms