Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms