Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX2P28328 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms