Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
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