Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms