Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP1P21291 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP1P21291 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP1P21291 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP1P21291 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP1P21291 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP1P21291 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP1P21291 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP1P21291 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP1P21291 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP1P21291 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP1P21291 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP1P21291 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP1P21291 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP1P21291 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP1P21291 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP1P21291 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms