Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATF3P18847 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATF3P18847 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATF3P18847 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATF3P18847 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATF3P18847 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATF3P18847 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATF3P18847 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATF3P18847 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF3P18847 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms