Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms