Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms