Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POP4O95707 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POP4O95707 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms