Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABARAPO95166 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms