Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UPP2O95045 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP2O95045 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP2O95045 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP2O95045 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms