Protein–RNA interactions for Protein: O60294

LCMT2, tRNA wybutosine-synthesizing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT2O60294 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCMT2O60294 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms