Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX1O43812 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX1O43812 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX1O43812 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX1O43812 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX1O43812 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX1O43812 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX1O43812 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX1O43812 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX1O43812 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms