Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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