Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms