Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms