Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms