Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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