Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms