Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms