Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms