Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms