Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms