Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms