Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 PSMG2-210ENST00000590217 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms