Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms