Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms