Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRP2BPQ9P2M1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP2BPQ9P2M1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms