Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms