Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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