Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRDE2Q9H7Z3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms