Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms